Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC149Q6ZUS6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms