Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VITQ6UXI7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms