Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EEF1DP3Q658K8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms