Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAPD7Q5XG87 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms