Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM46CQ5VWP2 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms