Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGAP9Q5VTM2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 396.7 ms