Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB6CQ53S08 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms