Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS9

USP39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39Q53GS9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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USP39Q53GS9 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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USP39Q53GS9 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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USP39Q53GS9 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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USP39Q53GS9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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USP39Q53GS9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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USP39Q53GS9 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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USP39Q53GS9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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USP39Q53GS9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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USP39Q53GS9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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USP39Q53GS9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP39Q53GS9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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