Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYTL3Q4VX76 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms