Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC153Q494R4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms