Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

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Length 1,214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NBPF1Q3BBV0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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