Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSPP1Q1MSJ5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms