Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RTL8BQ17RB0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RTL8BQ17RB0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RTL8BQ17RB0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RTL8BQ17RB0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RTL8BQ17RB0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RTL8BQ17RB0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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RTL8BQ17RB0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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