Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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GABRA6Q16445 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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GABRA6Q16445 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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GABRA6Q16445 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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