Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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