Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDCD2Q16342 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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