Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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NPTX1Q15818 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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NPTX1Q15818 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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