Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF1AQ15573 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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