Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCEA2Q15560 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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