Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCM1Q15154 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms