Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDK5R1Q15078 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms