Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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BRD3Q15059 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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BRD3Q15059 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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