Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAM2Q15035 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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