Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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NFIXQ14938 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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NFIXQ14938 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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