Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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