Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RFTN1Q14699 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RFTN1Q14699 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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RFTN1Q14699 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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RFTN1Q14699 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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RFTN1Q14699 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFTN1Q14699 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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