Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TRIM25Q14258 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TRIM25Q14258 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TRIM25Q14258 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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