Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COL9A3Q14050 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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COL9A3Q14050 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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COL9A3Q14050 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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COL9A3Q14050 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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COL9A3Q14050 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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COL9A3Q14050 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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COL9A3Q14050 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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