Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDAC1Q13547 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
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