Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TCIRG1Q13488 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCIRG1Q13488 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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