Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GOLGA4Q13439 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms