Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P3Q13401 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PMS2P3Q13401 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms