Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF1Q13077 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms