Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GRIK2Q13002 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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