Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC10A2Q12908 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC10A2Q12908 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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