Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms