Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CD300CQ08708 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms