Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms