Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXM1Q08050 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms