Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms