Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms