Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALD1Q05682 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms