Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DSG1Q02413 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms