Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms