Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2P78314 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP2P78314 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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