Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HBA1P69905 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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HBA1P69905 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HBA1P69905 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HBA1P69905 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HBA1P69905 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HBA1P69905 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HBA1P69905 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HBA1P69905 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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HBA1P69905 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HBA1P69905 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HBA1P69905 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HBA1P69905 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HBA1P69905 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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