Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms