Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms