Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AIF1P55008 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AIF1P55008 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AIF1P55008 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AIF1P55008 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AIF1P55008 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AIF1P55008 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AIF1P55008 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AIF1P55008 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AIF1P55008 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIF1P55008 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIF1P55008 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIF1P55008 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
AIF1P55008 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIF1P55008 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIF1P55008 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIF1P55008 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIF1P55008 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIF1P55008 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIF1P55008 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AIF1P55008 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AIF1P55008 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms