Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PXNP49023 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PXNP49023 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PXNP49023 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms